Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMTK3Q96Q04 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
LMTK3Q96Q04 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMTK3Q96Q04 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMTK3Q96Q04 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms