Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GBP4Q96PP9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GBP4Q96PP9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GBP4Q96PP9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.5 ms