Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf85Q96MD7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf85Q96MD7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms