Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM227BQ96M60 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM227BQ96M60 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM227BQ96M60 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms