Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNIP3Q96KP6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNIP3Q96KP6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNIP3Q96KP6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms