Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM3Q96HU1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM3Q96HU1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGSM3Q96HU1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms