Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APIPQ96GX9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APIPQ96GX9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APIPQ96GX9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms