Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BORCS6Q96GS4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BORCS6Q96GS4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BORCS6Q96GS4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms