Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IFT43Q96FT9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IFT43Q96FT9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms