Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC4Q96FT7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms