Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NEIL1Q96FI4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEIL1Q96FI4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms