Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTERF3Q96E29 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MTERF3Q96E29 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MTERF3Q96E29 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms