Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RABGGTAQ92696 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RABGGTAQ92696 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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