Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EDEM1Q92611 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDEM1Q92611 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms