Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCG3Q8WXD2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms