Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSMCE1Q8WV22 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSMCE1Q8WV22 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms