Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN4Q8WUT4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN4Q8WUT4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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