Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDI1Q8WTU0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDI1Q8WTU0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms