Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3IL1Q8TBN0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3IL1Q8TBN0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms