Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BEST2Q8NFU1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEST2Q8NFU1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEST2Q8NFU1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms