Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC191Q8NCU4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC191Q8NCU4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC191Q8NCU4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms