Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDPRQ8NCN5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDPRQ8NCN5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDPRQ8NCN5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms