Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNAAF3Q8N9W5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DNAAF3Q8N9W5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms