Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTLL6Q8N841 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTLL6Q8N841 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TTLL6Q8N841 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TTLL6Q8N841 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TTLL6Q8N841 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms