Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN19Q8N6F1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN19Q8N6F1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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