Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC33Q8N5R6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC33Q8N5R6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms