Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4X5

AFAP1L2, Actin filament-associated protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFAP1L2Q8N4X5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFAP1L2Q8N4X5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AFAP1L2Q8N4X5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFAP1L2Q8N4X5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms