Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00518Q8N0U6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00518Q8N0U6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms