Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA2D3Q8IZS8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNA2D3Q8IZS8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms