Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMNTD2Q8IXW0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMNTD2Q8IXW0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms