Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYT12Q8IV01 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYT12Q8IV01 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms