Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GATAD2AQ86YP4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GATAD2AQ86YP4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms