Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS37DQ86XT2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS37DQ86XT2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS37DQ86XT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms