Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC84Q86UT8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC84Q86UT8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC84Q86UT8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms