Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAINQ86UA6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPAINQ86UA6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPAINQ86UA6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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