Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCGF5Q86SE9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCGF5Q86SE9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms