Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLNKQ7Z7G1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLNKQ7Z7G1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms