Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMC3Q7Z5M5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMC3Q7Z5M5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMC3Q7Z5M5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms