Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z53

FRA10AC1, Protein FRA10AC1, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRA10AC1Q70Z53 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRA10AC1Q70Z53 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRA10AC1Q70Z53 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms