Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUSD1Q6UWL2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUSD1Q6UWL2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms