Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATRAIDQ6UW56 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRAIDQ6UW56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms