Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRTC3Q6UUV7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms