Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RGMBQ6NW40 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RGMBQ6NW40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms