Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEE8

SLFN12L, Schlafen family member 12-like, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12LQ6IEE8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SLFN12LQ6IEE8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLFN12LQ6IEE8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms