Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRAMD4Q6IC98 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD4Q6IC98 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD4Q6IC98 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms