Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRAGBQ5VZM2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRAGBQ5VZM2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms