Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIN9Q5TKA1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LIN9Q5TKA1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms