Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PERM1Q5SV97 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PERM1Q5SV97 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms