Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PAPPA-AS1Q5QFB9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms