Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN4Q5MJ08 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN4Q5MJ08 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPANXN4Q5MJ08 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPANXN4Q5MJ08 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPANXN4Q5MJ08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms